据了解，对于审计问题，审计部门已依法发布审计报告，提出处理意见，并要求地方政府在整改期限届满后依法纠正结果。
审计还发现了一些问题，主要包括：一是开发控制不够，生态恢复不理想。例如，一些地方小水电过度开发，无序发展问题较为突出，有的还形成生态破坏；有的开发区未经批准设立，有的还与基本农田或禁止开发区重叠，有的。开发区污水集中处理设施不到位，5个国家重点湖泊不断整治，2017个水质仍在IV以下。二是污染控制存在一些薄弱环节。例如，跨区域和跨领域的环境问题的预防和控制仍然困难，一些敏感地区的城市污水处理厂到2017年底还没有达到第一级排放标准；一些城市固体废物填埋场或焚烧炉。对植物超载；部分地方性危险废物和医疗废物的贮存、运输和处置不规范；饮用水源一级保护区存在违法建设项目。部分饮用水源已超过水质标准，地下储油库未完成防渗改造。三，一些生态环境保护资金和项目绩效不高。例如，一些项目没有按时完成，导致大量的资金节约，一些项目未能达到预期效益后完成。
从审计情况来看，11个省和有关部门已采取积极措施，加强污染防治和生态恢复。通过召开相关会议，制定或修订了相关制度，实施了各项专项行动，实施了长河制度和湖泊长度长制度，促进了生态环境保护工作有序进行。据审计部门资源环境审计司司长介绍，加强了相关省份的污水和垃圾处理能力，加强了水和大气污染控制阶段的任务。建成后，生态环境质量得到了改善。
审计还集中在该国重要湖泊的污染控制。据介绍，近年来，各部门加大了对污染防治的投入，积极采取措施保护湖泊生态环境，一方面控制污染源，关闭污染源搬迁。养殖、清洁围网养殖、治理畜禽养殖、减少污染、优化取水、排污口设置，促进水污染防治。另一方面，在一定程度上实施生态修复工程、退耕还湖、保护非法码头、非法采砂、饮用水源等专项行动等专项行动。在一定程度上抑制了部分湖泊水质的下降。改善了生态环境，改善了断面水质。然而，这项审计还发现，2017个国家中5个重要湖泊的水质仍在2017以下，主要是总磷和
总氮超标。
审计结果表明，各级政府加大了对生态环境的保护力度。2016和2017年度，相关财政资金2518亿2400万元，其中中央财政1722亿1200万元，地方财政796亿1200万元。
与长江经济带生态环境保护有关的资金是扬子江经济带生态环境保护基金的总称，包括水污染防治资金、前期资金。防治大气污染、石漠化综合治理资金、矿山地质环境管理资金、重金属污染防治资金、退耕还草资金。
数据显示，截至2017年底，扬子江经济带10个省已建成2万4100个小型水电站。主要的负面影响包括：建筑密度过大，有的还没有开始进行环境评价，有的是在已建立的自然保护区，有的生态流还没有得到有效的保证，水的还原和脱水现象就是恶化，甚至河流的流动被打破。